2039 年，原本以技術立國、以經濟大國之名馳騁於極東的島國日本，被超國家間的組織GHQ 給武力介入，而在其統治之下保有了國家的型態。在此10 年前，突然其來的致命病毒Apocalypse Virus 開始蔓延，這也讓日本政府混入混亂並喪失身為政府的主要機能，此一事件即後來被稱為Lost Christmas 的歷史災害。但在鮮為人知的背後卻有著另一段的故事，2029 年12 月，在那一天下著雪的夜裡發生了某件事。